NTRK基因融合是用于泛癌種靶向治療重要的分子標志物,隨著(zhù)兩款泛癌種靶向藥物拉羅替尼和恩曲替尼的獲批上市,以及臨床數據卓越,NTRK基因已成為全球最火的抗癌靶點(diǎn)之一。
目前,多個(gè)癌種相關(guān)治療指南中均推薦檢測NTRK基因檢測。
8月25日,我國首部《中國實(shí)體瘤NTRK融合基因臨床診療專(zhuān)家共識》(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“共識”)正式發(fā)布。
NTRK融合基因治療建議、檢測方法、檢測時(shí)機、質(zhì)量控制提出共13條共識。
共識1:所有晚期成人實(shí)體瘤和兒童實(shí)體瘤患者均建議進(jìn)行NTRK融合基因檢測,并且根據不同癌種的特性采取不同的檢測策略。(推薦級別:強烈推薦)
共識2:晚期成人實(shí)體瘤和兒童實(shí)體瘤患者應該在標準治療前或者治療期間考慮進(jìn)行NTRK融合基因檢測;NTRK基因融合發(fā)生率高的局部晚期腫瘤患者應在新輔助治療前進(jìn)行檢測。(推薦級別:強烈推薦)
共識3:使用覆蓋NTRK基因內含子區域的NGS DNA panel或者全外顯子組檢測作為NTRK融合基因檢測的首要手段,NGS RNA panel或者轉錄組作為NTRK融合基因檢測的重要補充手段。NGS RNA panel比 DNA NGS panel具有更高的靈敏性,尤其在IHC呈陽(yáng)性,DNA NGS panel檢測陰性的情況下建議RNA NGS panel確認。在條件允許的情況下推薦同時(shí)提取FFPE切片的DNA和RNA,以達到并行開(kāi)展DNA和RNA 測序的目的。(推薦級別:強烈推薦)
共識4:ETV6-NTRK3 FISH檢測可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤的確診手段,其他類(lèi)型實(shí)體瘤則不建議。檢測陽(yáng)性患者建議進(jìn)一步通過(guò)NGS檢測確認相關(guān)結構變異事件是否具有生物學(xué)功能。(推薦等級:推薦)
共識5:RT-PCR檢測可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤和在已知伴侶基因的情況下的確診手段,如:ETV6-NTRK3的NTRK融合基因。其他類(lèi)型實(shí)體瘤則不合適。同時(shí)建議使用NGS檢測手段作為RT-PCR陰性患者的補充檢測手段。(推薦等級:推薦)
共識6:pan-TRK IHC可以作為NTRK融合基因發(fā)生率較低、NTRK基因不表達且常規條件下不推薦NGS DNA panel方法的癌種初篩方法。也可以作為NGS檢測手段的復核手段。(推薦等級:推薦)
共識7:按照NTRK 基因融合事件發(fā)生率、TRK蛋白生理性表達和NGS檢測普及度,建議以30%普及度作為區分普及度高低的標準,分為三類(lèi)腫瘤并進(jìn)行NTRK融合基因檢測。(推薦等級:推薦)
共識8:建議各醫院病理科建立起NTRK檢測的標準流程表,聯(lián)盟定期發(fā)布各癌種NGS檢測臨床意義重要性分級建議,在腫瘤精準診療快速發(fā)展的過(guò)程中以NTRK融合基因檢測為標志,積極促進(jìn)各級醫院精準診療的發(fā)展。(推薦等級:推薦)
共識9:各類(lèi)檢測應該在具有醫學(xué)檢驗資質(zhì)的實(shí)驗室中進(jìn)行,建議選擇通過(guò)如ISO15189、CAP、CLIA等權威機構認證的實(shí)驗室。實(shí)驗室需要按規范開(kāi)展NTRK室間質(zhì)控與室內質(zhì)控。(推薦等級:強烈推薦)
共識10:通過(guò)病理質(zhì)控的FFPE腫瘤組織方可用于NTRK 融合基因檢測。在腫瘤組織獲取困難或FFPE樣本中腫瘤細胞含量不足的情況下,晚期腫瘤患者可選擇采集外周血進(jìn)行基于ctDNA的檢測;一般來(lái)說(shuō)新鮮樣本是RNA檢測最佳材料,如可以獲取且確保取材含有足夠腫瘤組織/細胞的新鮮樣本,也可以用于DNA+RNA檢測,但因取材經(jīng)驗不足,可能存在取樣組織中腫瘤細胞含量不足的風(fēng)險;推薦活檢組織在10%福爾馬林中浸泡6-12小時(shí),手術(shù)組織浸泡24-48小時(shí)。選擇FFPE樣本做DNA和RNA NGS檢測時(shí),盡量選擇最近時(shí)間段的樣本,原則不應超過(guò)兩年。選取的切片中需要有一定比例的腫瘤細胞,以滿(mǎn)足不同檢測平臺的檢測要求。一般做IHC或者FISH時(shí),至少需要50個(gè)腫瘤細胞;RT-PCR需要至少5%的腫瘤細胞;NGS檢測建議樣本的腫瘤細胞含量至少在20%以上。
如果切片中腫瘤細胞含量太少,可以考慮顯微切割等方式進(jìn)行腫瘤組織的富集。切取不同患者腫瘤樣本時(shí)應有效清理或者更換刀片和攤片池水,避免蠟片交叉污染。
包含NTRK 融合基因的NGS DNA檢測產(chǎn)品必須注明融合基因探針覆蓋區域(包括內含子),為盡量避免假陰性,建議選擇覆蓋區域比較完整或者同時(shí)含有NGS RNA檢測的產(chǎn)品。(推薦等級:強烈推薦)
共識11:檢測報告除了常規基本信息與質(zhì)控信息外,應該包括樣本腫瘤細胞含量的比例、是否經(jīng)過(guò)顯微切割富集腫瘤組織及細胞、提取的DNA濃度和純度等指標。NGS檢測報告融合陽(yáng)性需要包含斷點(diǎn)染色體位置信息、酪氨酸酶結構域包含情況和是否框內轉錄等信息。NGS報告中符合酪氨酸激酶結構域包含和非閱讀框改變才可考慮報NTRK 融合基因,不滿(mǎn)足的情況下需要報NTRK融合基因。(推薦等級:強烈推薦)
共識12:不同檢測方法之間結果不一致、新發(fā)現融合伴侶或者融合基因結構、復雜融合事件、未能清晰判斷是否為框內轉錄、未能清晰是否包含完整酪氨酸酶結構域或者多個(gè)驅動(dòng)基因陽(yáng)性等其他臨床醫生有疑問(wèn)的情況下,建議通過(guò)MTB(分子腫瘤專(zhuān)家委員會(huì ))討論后決定下一步治療方案。(推薦等級:強烈推薦)
共識13:建議NTRK融合基因的實(shí)體瘤患者臨床使用拉羅替尼、恩曲替尼等TRK抑制劑或者參加相關(guān)TRK抑制劑臨床試驗。NTRK融合基因耐藥患者推薦使用NGS檢測發(fā)現耐藥突變,以便于判斷是否適合參加二代TRK抑制劑治療或者臨床試驗。(推薦等級:強烈推薦)
全國共有49家實(shí)驗室報名參加,其中45家提交有效結果,僅23家通過(guò)評價(jià)活動(dòng),通過(guò)率為51.1%。
由中國臨床腫瘤學(xué)會(huì )(CSCO)主辦的"2020年中國臨床腫瘤學(xué)年度進(jìn)展研討會(huì )"近日于線(xiàn)上順利召開(kāi),會(huì )上專(zhuān)家學(xué)者們對2020CSCO消化道腫瘤指南更新做了總結,近幾年頗受關(guān)注的免疫治療在新版指南中地位突顯,地位相較于舊版指南有所提升。
由伯明翰大學(xué)癌癥研究中心英國臨床試驗小組領(lǐng)導的一項開(kāi)拓性的肺癌研究強調了下一波精準醫學(xué)研究,特別是治療基因組復雜癌癥需要考慮的重要因素。